Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Mterf1bB9EJ57 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Mterf1bB9EJ57 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Mterf1bB9EJ57 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mterf1bB9EJ57 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mterf1bB9EJ57 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mterf1bB9EJ57 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mterf1bB9EJ57 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mterf1bB9EJ57 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mterf1bB9EJ57 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mterf1bB9EJ57 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mterf1bB9EJ57 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mterf1bB9EJ57 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mterf1bB9EJ57 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mterf1bB9EJ57 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mterf1bB9EJ57 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms