Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Gm20547B8JJN0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
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Gm20547B8JJN0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20547B8JJN0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20547B8JJN0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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