Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms