Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf3B2RQG2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms