Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms