Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Trabd2bB1ATG9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Trabd2bB1ATG9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms