Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms