Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms