Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms