Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms