Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gm6880A3KG45 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6880A3KG45 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Gm6880A3KG45 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms