Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms