Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl41A2AUC9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms