Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms