Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms