Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms