Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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Pramef6A2A8M8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Pramef6A2A8M8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms