Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l1A2A259 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms