Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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