Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H3

Trbv16, T cell receptor beta, variable 16 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv16A0A0B4J1H3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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