Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Trbv2A0A0B4J1G8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Trbv2A0A0B4J1G8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv2A0A0B4J1G8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv2A0A0B4J1G8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Trbv2A0A0B4J1G8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Trbv2A0A0B4J1G8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Trbv2A0A0B4J1G8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Trbv2A0A0B4J1G8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Trbv2A0A0B4J1G8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Trbv2A0A0B4J1G8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trbv2A0A0B4J1G8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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