Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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