Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Atg3Q9CPX6 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Atg3Q9CPX6 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Atg3Q9CPX6 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Atg3Q9CPX6 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Atg3Q9CPX6 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Atg3Q9CPX6 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms