Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms