Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 AC166574.2-201ENSMUST00000226751 381 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Parpbp-201ENSMUST00000048518 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Sez6l2-203ENSMUST00000106335 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Zfp958-201ENSMUST00000073201 1401 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Osmr-204ENSMUST00000176826 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Akap6-202ENSMUST00000219786 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Cwc22-203ENSMUST00000111819 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Akap8-201ENSMUST00000002699 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Apex2-201ENSMUST00000026303 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Lhx6-202ENSMUST00000112961 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Zfp551-202ENSMUST00000120220 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Prb1-201ENSMUST00000087853 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Eif2d-201ENSMUST00000068791 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Lrit2-201ENSMUST00000057176 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Slc28a2-202ENSMUST00000110524 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Sytl4-202ENSMUST00000113294 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm29447-201ENSMUST00000186407 1500 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm29313-201ENSMUST00000187866 1500 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm28252-201ENSMUST00000188457 1500 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm28950-203ENSMUST00000188826 1500 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm29342-202ENSMUST00000189689 1500 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm29116-202ENSMUST00000189963 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm28726-201ENSMUST00000190994 1500 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Cwc25-201ENSMUST00000018685 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 AC117656.3-203ENSMUST00000225007 1809 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Slc31a1-201ENSMUST00000084526 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Zfp62-203ENSMUST00000109198 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 4933416O17Rik-201ENSMUST00000220972 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Osgepl1-202ENSMUST00000114484 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm26773-201ENSMUST00000180772 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm14561-201ENSMUST00000117376 798 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm9169-201ENSMUST00000182930 536 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm27353-201ENSMUST00000184712 122 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm36398-201ENSMUST00000192255 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm30312-201ENSMUST00000194516 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 AC160338.2-201ENSMUST00000215508 281 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 AC125350.5-201ENSMUST00000226102 517 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Vps8-202ENSMUST00000096192 4942 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gpr55-201ENSMUST00000086975 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Def8-202ENSMUST00000065534 3127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Cyp1a1-202ENSMUST00000216433 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm37464-201ENSMUST00000192431 2220 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Cops2-201ENSMUST00000028635 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Cd99l2-203ENSMUST00000114586 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Prkaa2-201ENSMUST00000030243 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 AC164625.1-201ENSMUST00000214034 3036 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm42856-201ENSMUST00000200848 2852 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Erc2-210ENSMUST00000211145 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Slc1a1-201ENSMUST00000025875 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Cnga2-201ENSMUST00000006020 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Pde10a-203ENSMUST00000115708 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Pitrm1-207ENSMUST00000222485 3906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Selenop-201ENSMUST00000082424 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sox12Q04890 Lonp2-203ENSMUST00000122188 2372 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms