Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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Hoxd13P70217 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Hoxd13P70217 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Hoxd13P70217 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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Hoxd13P70217 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Hoxd13P70217 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Hoxd13P70217 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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