Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms