Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Hoxc11P31313 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Hoxc11P31313 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Hoxc11P31313 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Hoxc11P31313 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms