Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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Cldn34c3J3QJW5 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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Cldn34c3J3QJW5 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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