Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Vmn1r40-202ENSMUST00000226925 3011 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm15721-201ENSMUST00000138406 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp9yF8VPU6 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms