Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms