Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gpr85-203ENSMUST00000115492 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Mapk6-202ENSMUST00000168937 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Rbm28-201ENSMUST00000007993 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm36799-201ENSMUST00000214113 1737 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gja1-206ENSMUST00000220069 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Srgap2-201ENSMUST00000097588 8026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Cwc22-205ENSMUST00000111824 2603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr806-203ENSMUST00000215142 3108 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 6820431F20Rik-202ENSMUST00000153748 4659 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Pum3-201ENSMUST00000076219 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Aoc1-203ENSMUST00000162948 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Fignl1-206ENSMUST00000171080 2844 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Atf7-203ENSMUST00000169033 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 A730065G17Rik-201ENSMUST00000217082 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Lmx1a-201ENSMUST00000028003 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm44764-202ENSMUST00000204912 671 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gng2-201ENSMUST00000055100 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Klhl41-201ENSMUST00000100050 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Grip1-215ENSMUST00000148954 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm11690-201ENSMUST00000128183 1856 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Il6st-209ENSMUST00000184445 1870 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr1312-202ENSMUST00000213582 2891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Psg19-201ENSMUST00000004657 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Sgsh-201ENSMUST00000005173 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Zfp939-201ENSMUST00000061201 2131 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Cpa4-201ENSMUST00000049251 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm37673-201ENSMUST00000194880 2451 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Lrtm2-202ENSMUST00000112756 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Slc2a5-201ENSMUST00000030826 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Slc12a8-201ENSMUST00000059056 3166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Col15a1-204ENSMUST00000107731 3253 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Drp2-204ENSMUST00000113228 3141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms