Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Slc7a14-201ENSMUST00000091259 8897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Ebpl-201ENSMUST00000022494 10092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Ttc26-205ENSMUST00000162554 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms