Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Usp27Q8CEG8 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Usp27Q8CEG8 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Usp27Q8CEG8 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Usp27Q8CEG8 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Usp27Q8CEG8 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Usp27Q8CEG8 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Usp27Q8CEG8 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Usp27Q8CEG8 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Usp27Q8CEG8 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Usp27Q8CEG8 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Usp27Q8CEG8 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Usp27Q8CEG8 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Usp27Q8CEG8 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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Usp27Q8CEG8 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp27Q8CEG8 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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