Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms