Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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