Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
TtrP07309 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TtrP07309 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TtrP07309 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TtrP07309 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TtrP07309 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TtrP07309 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TtrP07309 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms