Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Cldn18P56857 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Cldn18P56857 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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