Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd10P28359 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms