Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC162176.1-201ENSMUST00000216490 618 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms