Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim17Q7TPM3 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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