Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxa13Q62424 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Hoxa13Q62424 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Hoxa13Q62424 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Hoxa13Q62424 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms