Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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