Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Entpd5-201ENSMUST00000021662 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Ikbkg-207ENSMUST00000114133 6994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms