Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm44014-201ENSMUST00000205150 1509 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms