Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Olfr802-202ENSMUST00000203785 5535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm9866-203ENSMUST00000182592 8487 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Siah1bQ06985 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms