Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn18P56857 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms