Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctnna3Q65CL1 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms