Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm45294-201ENSMUST00000210685 2102 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Zfp637-211ENSMUST00000223041 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm5614-201ENSMUST00000091097 318 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Rpgr-204ENSMUST00000115532 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Phc1-202ENSMUST00000081849 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1221-202ENSMUST00000143255 2800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Serinc4-201ENSMUST00000056312 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc49-202ENSMUST00000065603 3017 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gprasp2-211ENSMUST00000173804 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Myo1h-201ENSMUST00000124316 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Pla2g6-210ENSMUST00000174021 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo3-203ENSMUST00000111135 3740 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpk-221ENSMUST00000177497 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Atg4a-201ENSMUST00000112971 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Pcdhga1-202ENSMUST00000194888 3247 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Zfp820-201ENSMUST00000084141 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Kif9-201ENSMUST00000061155 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Mtmr4-202ENSMUST00000103179 5753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Slc11a2-205ENSMUST00000138843 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Patj-202ENSMUST00000041284 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm36952-201ENSMUST00000194923 3625 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm9903-201ENSMUST00000181102 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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Lrrc43Q3V0L5 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Olfr503-201ENSMUST00000078162 972 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Kdm5a-201ENSMUST00000005108 10944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm1988-201ENSMUST00000188190 2565 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Sox5-205ENSMUST00000111749 3879 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Prss35-201ENSMUST00000036426 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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