Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms